舟山自贸区是中国设立的自由贸易试验区之一，注册公司的流程一般与其他地区有所不同。以下是一般在舟山自贸区注册公司的流程：
公司名称核准：首先，申请人需要到当地市场监督管理局进行公司名称核准，确保公司名称符合规定并未被他人注册。
准备注册资料：准备注册公司所需的资料，包括法定代表人身份证明、股东身份证明、公司章程、注册资本等。
在舟山自贸区管理机构办理注册：将准备好的注册资料提交给舟山自贸区管理机构，填写《企业设立登记申请表》，并缴纳注册费用。
审核和登记：舟山自贸区管理机构会对提交的注册资料进行审核，核实信息真实有效，审核通过后办理公司登记手续。
领取营业执照：经过审核和登记后，舟山自贸区管理机构会颁发营业执照，标志着公司注册成功。
办理税务登记：注册完成后，申请人需要到税务局办理税务登记，领取税务登记证。
开立银行账户：根据要求，申请人需要在指定银行开立公司银行账户。
其他许可证件：根据公司经营范围的不同，可能需要办理其他相关许可证件，如危险化学品经营许可证等。

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